Zotero 基础设置填坑记

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Zotero 是一款文件管理软件，阳志平老师力荐，入门有一些门槛，上一周终于破门而入，基础设置成功，记录下来，以备参考、学习。我的设置是按照阳志平老师的 zotero 系列博文来设置的，我记录一下自己遇到的坑以及解决方案。请先参考 Zotero 入门系列。

下载、安装及注册

  1. 关于 Zotero sandstone 的版本选择

    Zotero 最新的版本是 5.x，经过实践，到这篇文章的写作时间，仍然有部分插件不支持 Zotero 5，因此，我还是退回到 Zotero 4 版本。

    下载地址：Zotero - Downloads

  2. 除了 PC 版本的 Zotero sandstone，再下载一个 Zotero Connector 作为浏览器插件。

  3. 然后在 Zotero 网页版点击 Register 注册一个用户。

配置 Zotero

按照 Zotero（1）：文献管理软件Zotero基础及进阶示范 一路设置下去，我遇到过的坑，可能也是你遇到的问题。

  1. 关于 Windows 客户端 Search（检索）–> PDF Indexing（PDF 索引）的设置，请参考 研发狗日记17-Zotero小白安装记（1） 。诗颖小伙伴想尽叙述了这一过程和解决方案。 mac 客户端没有这一道坎儿。

  2. 云盘同步

Zotero 自己提供的空间有限，因此，我们要将存放文档的文件夹提出来放在云端，达到节约空间的目的。具体的思路就是：将 Zotero 中存放文档的 storage 文件夹剪切到云端，然后建立一个软连接到 Zotero 下的 storage 文件夹，实现两个文件夹的同步，而又不占用 Zotero 的空间。

这里又涉及到几个问题：

  • 关于云端的选择

    阳老师使用的是 Dropbox，经过实践，还是跟阳老师的步调一致比较好，方便后面的设置。因为后面如果要使用 Notability（一款笔记 App）标记 PDF 的话，并且实现电脑和平板之间的互动传递，Dropbox 是首选云端，并且没有国内云端的选项。

  • 关于软连接的建立，也就是如何同步。

    第一步就是将 Zotero 目录下 storage 文件夹剪切出来。有的同学找不到 storage，那么你去找一篇 PDF 文档储存到 Zotero 它就出来了，而 Zotero 5 版本直接就有。

    第二步也是关键的一步，建立软连接。阳老师使用的是命令行：

    ln -s /users/ouyang/dropbox/zotero/storage /users/ouyang/dev/zotero/storage

    技术小白咋办？思路：找到你电脑的终端，把上面的命令行拷贝到你的终端，并且把文件的路径修改为你自己的路径，按回车。（此处搜索关键词：软连接，终端）操作成功的样子：

基础配置完成以后，就可以尝试一下各种导入了，神奇到爆！

建立一些自己的搜索分类

参考：Zotero（2）：作为知识管理工具的Zotero

按照阳老师博客的示范，建立一些神奇又方便的搜索如下：

熟悉 Zotero 操作之后可以自己开发新的搜索需求。

在 iPad 上使用 Zotero

参考：Zotero（3）：平板与社交：再谈研究辅助工具Zotero兼配套APP

最开始没太懂原理，看了几遍之后明白了，就是在 iPad 的 Safari 创建一个类似浏览器插件的按钮，只不过这个按钮的形式是 Safari 收藏夹中的书签，每当有需要导入到 Zotero 的内容，则点一下书签，便成功地导入到 Zotero 了。具体步骤按照阳老师文章中的提示，难度不大，iPad Safari 设置成功入下图，比如我想把豆瓣《自私的基因》这本书的信息导入到 Zotero：

再来看一下电脑端 Zotero 里面的内容，《自私的基因》马上导入进来了。

使用 Notability，通过 Dropbox 导入到 Zotero 里面的 PDF 文档，并写批注。

Notability 是一款 PDF 阅读器，好评如潮。设置请参考 Zotero（3）：平板与社交：再谈研究辅助工具Zotero兼配套APP 基本没有难度。

但是我稍微做了一些自己的调整。使用 Notability 之后，被其强大吸引，不仅可以批注 PDF，其笔记功能也十分强大，因此，打算用它做笔记，就不局限在 zotero 的文档。在之前的设置中 Dropbox 云端建立了 zotero 文件夹，不想把其他的杂乱东西也同步上去，因此在设置 Notability 自动同步到 Dropbox 的时候仅选择了 Notability 中的一个主题。具体方法是现在 Notability 建立一个 note 主题，然后设置同步的时候，「目标位置」选择 /zotero/, 备份主题选择 note，如下图：

其它的主题我打算同步到 Google Drive，这也是前两篇文章存在的原因。

插件安装

  1. zotfile

    zotero/storage 目录导出的文档是下面（图一）这样的，比较凌乱，因此需要用 zotfile 插件方便在 iPad 上找到文档，使用 zotfile 后的呈现（图二）

    （图一）

    （图二）

    参考 Zotero（4）：Zotero之Zotfile插件的使用 进行设置。

    基本思路是导入到 Zotero 的 PDF 文档使用 「Manage Attachments」选项（安装 zotfile 才有），可以 「Rename Attachments」，然后将其发送到 iPad 「Send to Tablet」，在 iPad 上阅读批注之后，还能导回来「Get from Tablet」。

    在这个过程中我遇到过一个错误报告，复述如下：

    Zotfile: Renamed Attachments Attachments skipped because they are top-level items, snapshots or the file does not exist.

    Google 了很多英文文档都没能解决问题，结果一个知乎解决了。抱歉我暂时找不到这篇文章了，简单说一下，就是我保存的 PDF 不是附件的形式，因此 Zotfile 找不到。解决的办法是右键点击 PDF 文档 –> Retrieve Metadata for PDF（检索 PDF 元数据）。

    之后 按照阳老师文章中的方法，Zotfile 就起作用了。具体操作参考官方文档： ZotFile - Advanced PDF management for Zotero

  2. papermachine

    这个插件可以对一个类别论文进行「文献可视化」分析，下载安装基本没有难度，但是我并没有实现可视化词云，也许是我的 Zotero 还没有那么多文档的缘故，过一段时间在看一下。

    下载地址：Paper Machines

  3. Markdown here

    用 Markdown 在 Zotero 里做笔记用的，参考 Zotero（5）：电子文献管理攻略 问题 6

到此，Zotero 基础设置完成，用了大概 48 小时的探索，时间跨度一周。接下来，开启神奇之旅……

2017-12-18 10: 02

参考文档